在深圳市委六届十一次全会对全市深化机构改革工作进行动员部署后，1月10日，《深圳市机构改革方案》正式发布。和广州前一天发布的机构改革方案一样，深圳也共设置党政机构53个，但是和广州的架构略有不同。深圳设置的53个市级党政机构中，党委机构19个（设在相关部门的市委议事协调机构的办事机构不计入机构限额），其中，纪检监察机关1个，工作机关18个；政府机构34个。

　　建立健全和优化市委对重大工作的领导体制机制

　　组建市监察委员会

　　落实党中央关于深化监察体制改革的部署,将市监察局、市预防腐败局的职责,以及市人民检察院查处贪污贿赂、失职渎职及预防职务犯罪等反腐败相关职责整合,组建市监察委员会,同市纪律检査委员会合署办公,履行纪检、监察两项职责,实行一套工作机构、两个机关名称。不再保留市监察局、市预防腐败局。

　　组建市委审计委员会

　　作为市委议事协调机构，市委审计委员会办公室设在市审计局。

　　组建市委教育工作领导小组

　　作为市委议事协调机构，市委教育工作领导小组办公室设在市教育局。

　　设市委全面深化改革委员会

　　将市委全面深化改革领导小组改为市委全面深化改革委员会,作为市委议事协调机构。市委全面深化改革委员会办公室设在市委政策研究室。

　　设市委全面依法治市委员会

　　将市委全面依法治市工作领导小组改为市委全面依法治市委员会,作为市委议事协调机构。市委全面依法治市委员会办公室设在市司法局。

　　设市委网络安全和信息化委员会

　　将市委网络安全和信息化领导小组改为市委网络安全和信息化委员会,作为市委议事协调机构。市委网络安全和信息化委员会办公室为市委网络安全和信息化委员会的办事机构,作为市委工作机关,归口市委宣传部管理,对外加挂市互联网信息办公室牌子

　　组建市委外事工作委员会,作为市委议事协调机构。市委外事工作委员会办公室为市委外事工作委员会的办事机构,作为市委工作机关,与市政府外事办公室合署办公。

　　加强市委职能部门的统一归口协调管理职能

　　市委组织部统一管理市委机构编制委员会办公室

　　将市机构编制委员会改为市委机构编制委员会,作为市委议事协调机构。调整优化市委机构编制委员会领导体制。市委机构编制委员会办公室作为市委机构编制委员会的办事机构,承担市委机构编制委员会的日常工作,作为市委工作机关,归口市委组织部管理。

　　市委组织部统一管理公务员工作

　　将市人力资源和社会保障局承担的有关公务员管理职责划入市委组织部,对外加挂市公务员局牌子。

　　市委宣传部统一管理新闻出版和电影工作

　　将市文体旅游局的新闻出版、电影管理职责划入市委宣传部,对外加挂市新闻出版局牌子。

　　新组建和优化职责的机构

　　组建市规划和自然资源局

　　将市规划和国土资源委员会(市海洋局)的职责,市林业局的职责,市发展和改革委员会的配合编制主体功能区规划职责,市经济贸易和信息化委员会的渔业管理职责,市水务局的水资源调查职责,以及相关部门的自然保护区、风景名胜区、自然遗产、地质公园等管理职责整合,组建市规划和自然资源局,加挂市海洋渔业局、市林业局牌子。市规划和自然资源局在区设分局,实行市以下垂直管理体制。

　　不再保留市规划和国土资源委员会。

　　组建市生态环境局

　　将市人居环境委员会的职责，市发展和改革委员会的应对气候变化和减排、碳排放交易管理职责,市规划和国土资源委员会的监督防止地下水污染职责,市经济贸易和信息化委员会的监督指导农业面源污染治理职责,市水务局的编制水功能区划、排污口设置管理职责,市海洋局的海洋环境保护职责整合,组建市生态环境局。市生态环境局在区设分局,实行市以下垂直管理体制。不再保留市人居环境委员会。

　　组建市卫生健康委员会。

　　市卫生和计划生育委员会的职责,市公立医院管理中心的行政职能,市安全生产监督管理局的用人单位作业场所职业卫生监督管理职责,市医疗卫生事业改革发展领导小组办公室的职责,市老龄工作委员会办公室的职责,市爱国卫生运动委员会办公室的职责整合,组建市卫生健康委员会。市老龄工作委员会的日常工作由市卫生健康委员会承担。不再保留市卫生和计划生育委员会。

　　组建市退役军人事务局

　　将市民政局的退役军人优抚安置、双拥工作职责,市人力资源和社会保障局的军官转业安置职责以及军队有关职责等整合,组建市退役军人事务局,按中央有关改革部署实施。

　　组建市应急管理局

　　将市政府应急管理办公室(市民防委员会办公室、市地震局、市核应急管理办公室)除人防管理以外的职责,市安全生产监督管理局的职责,市公安局的消防管理职责,市规划和国土资源委员会的指导协调地质灾害防治相关职责,市民政局的救灾职责,市林业局的森林防火职责,市减灾委员会、市三防指挥部、市森林防火指挥部的职责整合,组建市应急管理局,加挂市地震局、市核应急管理办公室牌子,按中央有关改革部署实施。不再保留市政府应急管理办公室、市安全生产监督管理局。

　　重新组建市司法局

　　将市司法局、市政府法制办公室(市政府法律顾问室)的职责整合,重新组建市司法局。不再保留市政府法制办公室。

　　优化市审计局职责

　　将市发展和改革委员会的重大项目稽察职责,市财政委员会的预算执行情况和其他财政收文情况的监督检查职责,市政府国有资产监督管理委.员会对直接监管企业负责人经济责任审计的职责划入市审计局。

　　重新组建市市场监督管理局

　　将市市场和质量监督管理委员会(市食品药品监督管理局、市市场监督管理局〈市知识产权局、审质量管理局〉)的职资,市经济贸易和信息化委员会的农业、畜牧业管理职责以及配合开展经营者集中反垄斷执法职责整合,重新组建市市场监督管理局,加挂市知识产权局牌子。市市场监督管理局在区设分局,实行市以下垂直管理体制。不再保留市市场和质量监督管理委员会。

　　组建市医疗保障局

　　将市人力资源和社会保障局的医疗保险、生育保险职责,以及纳入医保范围的医疗服务机构、医疗服务行为、医疗费用等的监督管理职责,市发展和改革委员会的医疗服务定价管理职责,市卫生和计划生育委员会的药品和医用耗材招标釆购管理职责,市民政局的医疗救助职责整合,组建市医疗保障局。市医疗保障局在区设分局,实行市以下垂直管理体制。

　　理顺市档案局(市档案馆、市城建档案馆)职责

　　将市档案局的行政职能划入市委办公厅,市委办公厅对外加挂市档局牌子。市档案馆(市城建档案馆)作为市委直属事业单位。

　　组建市政务服务数据管理局

　　将市政务服务管理办公室的行政职能,市经济贸易和信息化委员会电子政务、信息安全管理、大数据管理、统筹“智慧城市”建设的职责,市委市政府信访局的“12345”公开电话管理职责,以及相关机构的信息化职责整合,组建市政务服务数据管理局,统一负责政务服务管理、“互联网十政务服务”、政务数据管理等工作。

　　将市国税地税机构合并

　　按照中央有关部署,配合做好国税地税征管体制改革。

　　不再设立以下机构

　　不再设立市社会治安综合治理委员会及其办公室、市委维护稳定工作领导小组及其办公室,有关职责交由市委政法委员会承担。将市委防范和处理邪教问题领导小组及其办公室职责交由市委政法委员会、市公安局承担。

　　与中央和省级机构基本对应的其他机构

　　包括4个市委工作机关和18个市政府工作部门

　　市委办公厅、市委统一战线工作部、市直属机关工作委员会、市委巡察工作领导小组办公室作为市委工作机关;市政府办公厅、市发展和改革委员会、市教育局、市科技创新委员会、市工业和信息化局、市公安局、市民政局、市财政局、市人力资源和社会保障局、市住房和建设局、市交通运输局、市水务局、市商务局、市文化广电旅游体育局、市政府国有资产监督管理委员会、市统计局、市地方金融监督管理局、市信访局作为市政府工作部门。

　　具体如下：

　　将市科技创新委员会(市国家自主创新示范区管理委员会)的职责,市人力资源和社会保障局的外国专家管理相关职整合,重新组建市科技创新委员会。市科技创新委员会加挂市国家自主创新示范区管理委员会、市高新技术产业园区管理委员会、市外国专家局牌子。

　　将市经济贸易和信息化委员会更名为市工业和信息化局。

　　将市财政委员会更名为市财政局。

　　将市交通运输委员会(市港务管理局)更名为市交通运输局,加挂市港务管理局牌子。

　　组建市商务局。将市投资推广署的行政职能,市经济贸易和信息化委员会(市保税区管理委员会)的外经贸商业、保税区管理职责整合,组建市商务局,加挂市保税区管理委员会牌子。

　　将市文体旅游局(市文物局)更名为市文化广电旅游体育局,加挂市文物局牌子。

　　市政府国有资产监督管理委员会加挂市集体资产管理办公室牌子。

　　将市政府金融发展服务办公室(市金融监督管理局)更名为市地方金融监督管理局,加挂市政府金融工作办公室牌子。

　　将市委市政府信访局(市信访大厅、市人民建议征集办公室)更名为市信访局。

　　因地制宜设置的机构

　　包括7个市委工作机关和6个市政府工作部门

　　市委军民融合发展委员会办公室、市委台湾工作办公室、市委推进粤港澳大湾区建设领导小组办公室、市委老干部局、市委保密委员会办公室、市委机要局、市人才工作局作为市委工作机关;市城市管理和综合执法局、市政府口岸办公室、市扶贫协作和合作交流办公室、市中小企业服务局、市社会组织管理局、市城市更新和土地整备局作为市政府工作部门。

　　具体如下：

　　组建市委国家安全委员会

　　作为市委议事协调机构。市委国家安全委员会办公室设在市委办公厅。

　　组建市委军民融合发展委员会

　　作为市委议事协调机构。市委军民融合发展委员会办公室为市委军民融合发展委员会的办事机构,作为市委工作机关,对外加挂市人民防空办公室、市国防科技工业办公室牌子。将市民防委员会办公室、市国防科技工业办公室等部门的职责划入市委军民融合发展委员会办公室。

　　将市民防委员会办公室的人防工程建设质量监督管理相关职责划入市住房和建设局。

　　组建市委推进粤港澳大湾区建设领导小组,作为市委议事协调机构。市委推进粤港澳大湾区建设领导小組办公室为市委推进粵港澳大湾区建设领导小组的办事机构,作为市委工作机关,与市政府港澳事务办公室合署办公。

　　重新组建市委老干部局

　　将市委老干部局的职责,市机关事务管理局的离退休干部服务有关职责整合,重新组建市委老干部局,作为市委工作机关,归口市委组织部管理.

　　将市委保密委员会办公室由市委办公厅内设机构调整为市委工作机关,归口市委办公厅管理,对外加挂市国家保密局牌子。

　　将市委机要局由市委办公厅内设机构调整为市委工作机关,归口市委办公厅管理,对外加挂市密码管理局牌子。

　　将市人才工作局由设在市委组织部调整为市委工作机关,归口市委组织部管理。

　　将市城市管理局(市城市管理行政执法局)更名为市城市管理和综合执法局。

　　组建市扶贫协作和合作交流办公室

　　划入市经济贸易和信息化委员会的对口帮扶、对口支援、扶贫协作、精准扶贫及经济协作等职责。

　　组建市中小企业服务局

　　将市中小企业服务署的行政职能,市经济贸易和信息化委员会的相关职责整合,组建市中小企业服务局,由市工业和信息化局统一领导和管理。

　　将市社会组织管理局由市民政局下设行政机构调整为市政府工作部门,由市民政局统一领导和管理。

　　组建市城市更新和土地整备局。将市城市更新局、市土地整备局的行政职能整合,由市规划和自然资源局统一领导和管理。

　　将市气象局(台)由市政府工作部门调整为市政府直属事业单位。

　　不再保留市社会工作委员会。

　　中共深圳市委机构设置表

　　纪律检查委员会监察委员会接机关

　　办公厅

　　组织部

　　宣传部

　　统一战线工作部

　　政法委员会

　　政策研究室

　　全面深化改革委员会办公室（设在政策研究室）

　　全面以法治市委员会办公室（设在办公厅）

　　国家安全委员会办公室（设在办公厅）

　　网络安全和信息化委员会办公室

　　外事工作委员会办公室

　　机构编制委员会办公室

　　军民融合发展委员会办公室

　　审计委员会办公室（设在市审计局）

　　教育工作领导小组办公室（设市教育局）

　　台湾工作室

　　推进粤港澳大湾区建设领导小组办公室

　　直属机关工作委员会

　　巡察工作领导小组办公室

　　老干部局

　　保密委员会办公室

　　机要局

　　市人才工作局

　　深圳市人民政府机构设置表

　　办公厅

　　发展和改革委员会

　　教育局

　　科技创新委员会

　　工业和信息化局

　　公安局

　　民政局

　　司法局

　　财政局

　　人力资源和社会保障局

　　规划和自然资源局

　　生态环境局

　　住房和建设局

　　交通运输局

　　水务局

　　商务局

　　文化广电旅游体育局

　　卫生健康委员会

　　退役军人事务局

　　应急管理局

　　审计局

　　国有资产监督管理委员会

　　市场监督管理局

　　统计局

　　医疗保障局

　　地方金融监督管理局

　　城市管理和综合执法局

　　口岸办公室

　　扶贫协作和合作交流办公室

　　信访局

　　政务服务数据管理局

　　中小企业服务局

　　社会组织管理局

　　城市更新和土地整备局

　　（来源：深圳大件事 记者：傅静怡 王睦广）